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Simgen SYBR Green PCR Mix的選擇

作者:新景實驗室
版權說明:本文系原創文章 轉載請標注出處和本文鏈接

近來有用戶反映Simgen2×SYBR Green PCR Mix7106100產品做PCR檢測,與某公司的SYBR Green Mix相比較,發現有CT值有增大的現象,這是為什么呢?

小編經過深入研究,發現當選用 2×SYBR Green PCR Mix 配合用戶的引物PCR檢測時,CT值就與某公司的SYBR Green Mix幾乎一致了。原來2×SYBR Green PCR Mix7106100)是追求高特異性的產品;而2×SYBR Green PCR Mix 則是追求高靈敏度的產品--但是它對于引物的要求會比較高,如果引物設計得不好,在PCR的過程中,模板起始濃度較低時很容易出現非特異擴增,下面就讓小編給大家介紹一下這兩款產品的優點及不足:

 

2×SYBR Green PCR Mix -兩款產品的優缺點以及不足對比
下面是兩款產品實例測試:
 

PCR體系配置

2×SYBR Green PCR Mix 兩款產品實例測試: PCR體系配置
2
×SYBR Green PCR Mix的標準曲線 
2×SYBR Green PCR Mix的標準曲線圖(圖1、圖2) 
 從上圖所述,2×SYBR Green PCR Mix7106100)的相關系數高達0.999,而且重復性高。

2×SYBR Green PCR Mix Ⅱ(7107100)的標準曲線

2×SYBR Green PCR Mix Ⅱ 的標準曲線圖(左:低濃度模板;右:高濃度模板) 


2×SYBR Green PCR Mix Ⅱ(7107100)標準曲線圖 

從上圖所述,2×SYBR Green PCR Mix在高濃度模板時,相關系數高達0.999,重復性高;但是引物設計不完美時,一旦有低模板濃度,就會出現非特異擴增,從而降低相關系數。

simgen-2×SYBR Green PCR Mix-溶解曲線圖  

CT值表

simgen-2×SYBR Green PCR Mix-CT值表
CT值表格及融解曲線看,可看出2×SYBR Green PCR MixⅡ在靈敏度上比2×SYBR Green PCR Mix7106100會高出0.5-1CT值左右,但是在低濃度模板時(10
-7),2×SYBR Green PCR MixⅡ的CT值出現異常,這是因為在引物設計的不是很好時,2×SYBR Green PCR MixⅡ在低濃度模板時易出現非特異擴增。  

綜上所述,2×SYBR Green PCR Mix7106100)的特異性比2×SYBR Green PCR Mix 高,但是在靈敏度上不如2×SYBR Green PCR Mix。所以倘若追求高特異性,小編推薦使用2×SYBR Green PCR Mix7106100,如果追求靈敏度,還是推薦使用2×SYBR Green PCR Mix

 

 

新景生物實驗室

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